Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FANCLQ9NW38 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCLQ9NW38 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms