Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX18Q9NVP1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX18Q9NVP1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms