Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SETD4Q9NVD3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SETD4Q9NVD3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms