Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM39AQ9NV64 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM39AQ9NV64 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39AQ9NV64 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM39AQ9NV64 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms