Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTM9

CUTC, Copper homeostasis protein cutC homolog, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTCQ9NTM9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUTCQ9NTM9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CUTCQ9NTM9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms