Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACSS2Q9NR19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSS2Q9NR19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms