Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB3Q9NQW8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB3Q9NQW8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB3Q9NQW8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB3Q9NQW8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB3Q9NQW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB3Q9NQW8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB3Q9NQW8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB3Q9NQW8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNGB3Q9NQW8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGB3Q9NQW8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB3Q9NQW8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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