Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRC4Q9NPP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRC4Q9NPP4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms