Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDH12Q9NPG4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDH12Q9NPG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH12Q9NPG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms