Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP4F12Q9HCS2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms