Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EBF2Q9HAK2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBF2Q9HAK2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms