Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUGCTQ9HAC7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUGCTQ9HAC7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUGCTQ9HAC7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUGCTQ9HAC7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUGCTQ9HAC7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUGCTQ9HAC7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUGCTQ9HAC7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUGCTQ9HAC7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms