Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1BQ9H9Y6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1BQ9H9Y6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms