Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRDE2Q9H7Z3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRDE2Q9H7Z3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms