Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNLQ9H714 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms