Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM38AQ9H6F2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms