Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STN1Q9H668 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STN1Q9H668 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STN1Q9H668 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STN1Q9H668 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STN1Q9H668 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STN1Q9H668 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STN1Q9H668 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STN1Q9H668 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STN1Q9H668 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms