Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4G0

EPB41L1, Band 4.1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L1Q9H4G0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L1Q9H4G0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L1Q9H4G0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPB41L1Q9H4G0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPB41L1Q9H4G0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPB41L1Q9H4G0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPB41L1Q9H4G0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L1Q9H4G0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms