Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD1Q9H3U5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD1Q9H3U5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD1Q9H3U5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD1Q9H3U5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD1Q9H3U5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD1Q9H3U5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD1Q9H3U5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD1Q9H3U5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD1Q9H3U5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD1Q9H3U5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD1Q9H3U5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms