Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXD1Q9GZZ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms