Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY4Q9C004 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRY4Q9C004 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms