Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN6Q9BZV1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN6Q9BZV1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN6Q9BZV1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN6Q9BZV1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN6Q9BZV1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN6Q9BZV1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN6Q9BZV1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN6Q9BZV1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN6Q9BZV1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms