Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM54Q9BYV2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM54Q9BYV2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms