Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC41.32■■■■■ 4.21
FANCD2Q9BXW9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC41.27■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
FANCD2Q9BXW9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
FANCD2Q9BXW9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.19■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC41.18■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.15■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC41.14■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
FANCD2Q9BXW9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
FANCD2Q9BXW9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms