Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms