Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
REPIN1Q9BWE0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REPIN1Q9BWE0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms