Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDC1Q9BTX1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDC1Q9BTX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms