Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN3Q9BTN0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN3Q9BTN0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms