Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPK3BQ9BT76 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UPK3BQ9BT76 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms