Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERPUD2Q9BSE4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD2Q9BSE4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms