Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN3Q9BQT9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSTN3Q9BQT9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms