Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HINFPQ9BQA5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HINFPQ9BQA5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HINFPQ9BQA5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms