Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms