Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF15Q99988 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF15Q99988 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms