Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP88Q99567 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NUP88Q99567 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP88Q99567 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP88Q99567 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms