Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MMS19Q96T76 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMS19Q96T76 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MMS19Q96T76 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms