Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NODALQ96S42 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms