Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDCD1Q96RS6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms