Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TGS1Q96RS0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGS1Q96RS0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGS1Q96RS0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TGS1Q96RS0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TGS1Q96RS0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TGS1Q96RS0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGS1Q96RS0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms