Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED4Q96RK1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms