Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEPDC7Q96QD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC7Q96QD5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms