Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A1Q96NT5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A1Q96NT5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms