Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC115Q96NT0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms