Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM20AQ96MK3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM20AQ96MK3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM20AQ96MK3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms