Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC74BQ96LY2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms