Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SGCZQ96LD1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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