Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP3Q96KP6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP3Q96KP6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms