Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS50Q96JG6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS50Q96JG6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms