Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK5RAP3Q96JB5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK5RAP3Q96JB5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms