Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIC2Q96JB3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIC2Q96JB3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIC2Q96JB3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HIC2Q96JB3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HIC2Q96JB3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIC2Q96JB3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIC2Q96JB3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIC2Q96JB3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIC2Q96JB3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIC2Q96JB3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIC2Q96JB3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms